ゲノム情報
研究用ツール
Primer3
PCR primer のデザインに有用。様々なパラメータの設定が可能です。
ChIP-Atlas
公共データベースに登録済みのChIP-seq、DNase-seq、ATAC-seq、Bisulfite-seqが統合されており、様々な用途へ応用可能です。
CRISPR関係ツール
CRISPick
BROAD Instituteが提供するguide RNAデザインツール。Knockout、CRISPRa、CRISPRiに対応。
CRISPRdirect
高速なguide RNAデザインツール。
CRISPR RGEN Tool
Microhomology検索、Base editing、Prime editing等の様々な用途に対応。
情報解析
先進ゲノム支援:情報解析講習会ビデオ
文科省・新学術領域研究「先進ゲノム支援」が開催した情報解析講習会の動画と講習会資料が提供されています。初心者向けと中級者向けがあります。
文献検索
Pubmed
米国国立医学図書館(NLM)によって作成された文献情報データベース。論文のAbstractを表示する機能があります。
Google Scholar
論文全体に対して検索がかかり、引用文献も提示されます。一方、PubmedのようなAbstract表示機能はありません。目的に応じて、両者を使い分けると便利です。